御祭神 大山祇（積）命
配 祀 和足彦神
身島姫神
上津姫命（雷神）
下津姫命（龍神）
御祭神は『三嶋大明神略縁起』による
三島神社の御祭神は大山祇命（おおやまつみのみこと）（おおやまづみのみこと）。「やまつみ」とは「山を持ち坐（いま）す」という意味を表しており、大山祇命は山の神様です。また、大山祇命は『伊予国風土記』では和多志大神（わたしのおおかみ）とされており、「わた」は海の古語であることから、海の神様でもあります。
大山祇命は天照大御神（あまてらすおおみかみ）の兄にあたる神様で、日本総鎮守の神様といわれています。
配祀としてお祭りしている、上津姫命は磐長姫命（いわながひめのみこと）、下津姫命は木花開耶姫命（このはなのさくやひめのみこと）と考えられており、大山祇命の娘にあたる神様で、この親子には次のような神話が残っています。
天照大御神（あまてらすおおみかみ）の孫として高天原（たかまのはら）から降臨した邇邇藝命（ににぎのみこと）は、美しい木花開耶姫命と出逢い、一目惚れします。そこで、父である大山祇命に結婚の許可をもらいにいくと、大山祇命は大変喜び、姉の磐長姫命共々、邇邇藝命に差し出しました。ところが邇邇藝命は、磐長姫命がとても醜かったので追い返してしまったのです。
実は、大山祇命が磐長姫命をも差し出したのは、邇邇藝命の命が磐のように恒久であれという誓約（うけい）に基づくものでした。誓約とは「そうならばこうなる、そうでないならばこうなる」とあらかじめ宣言し、その結果によって吉凶、成否などを判断する、古代の占いのこと。磐長姫命を返してしまったことで、邇邇藝命の子孫の神様は長命ではなくなったとされています。 現在では、磐長姫命は長寿の守護神として信仰されており、一方の木花開耶姫命は、火の中で邇邇藝命の子供を出産したという説話から、火の神や安産の神とされています。
なお、三島神社の御本社は、愛媛県今治市大三島にある元国幣大社（こくへいたいしゃ）の大山祇神社（おおやまづみじんじゃ）です。
